主要是以基督徒社群為對象,從事各種宣教事工的研討與訓練工作。並與台灣基督長老教會總會、中區會、地方教會,和其他機構合作,舉辦各種講座、訓練課程等(如:教牧進修班、長執與信徒訓練、青年造就營會等),積極參與宣教。
一、教牧進修班暨神學講座:
強化神學院與教會宣教事工的推展,定期舉辦聖經、歷史、神學、實踐等不同領域之教牧進修課程,藉由各種主題的探討,充實牧者之牧會神學,提昇教會基督教育與宣教實踐的功能。如雙連教會神學講座、東門教會神學講座、德生教會神學講座等。
二、原住民青少年全人發展生活營:
為關懷原住民教會青年,落實全人發展教育,本院於每年寒、暑假期間,與原住民中區會青年部、教育部合作,規劃有關信仰造就、族群認同教育、文化禮俗探源、傳統技藝之傳承與創新、勵志故事與見證分享,以及生涯規劃、交友、人際、體育活動等多元化之課程,使原住民青年獲得全人發展之培育。
三、原住民大學生聖經與文化研習營:
因應現代社會之快速變遷,積極培育原住民知識青年之信仰,進而服務教會,通過不同課程造就大學青年之信仰,並藉著有關族群、社會、文化、人文、生活等專題的探討,建立原住民大學青年從活潑的信仰,展現健全的生活價值觀,培育他們參與原住民教會之宣教使命。
四、全國四區教室(東、中、南、北):
提供台灣各地區原住民教會傳道人、長執進修暨信徒造就之機會,以擴展其神學見解,充實參與上帝國宣教之能力為宗旨。